冷冻电镜一般有120KV,200KV,300KV等类型，冷冻电镜一般包含主仪器室，操作间，辅助设备间等。

一般设置减震台以减小仪器的震动。

一般设置独立洁净空调系统保证房间洁净度。

一般主仪器室房间设置精密空调机组保证房间温度18-23℃，通过精确的自控传感器及控制逻辑保证24小时温度波动范围小于0.8℃。

通过合理的气流组织形式，及风口布置确保主仪器室内风速小于0.8m/s。

冷冻电镜整体尺寸高大，需预留足够的安装、运输通道。

冷冻电镜应避免受到高噪音和杂散磁场影响，因此安装时要远离电梯、电机、地铁等位置，并通过墙壁安装钢板或铜板屏蔽磁场干扰。